昇思MindSpore蛋白質結構預測模型研發(fā)進展

近期，基于全場景AI框架昇思MindSpore 開發(fā)的蛋白質結構預測模型在全球持續(xù)蛋白質結構預測競賽CAMEO(Continous Automated Model EvaluatiOn)上連續(xù)三周霸榜，并包攬月榜前二，顯示出昇騰AI基礎軟硬件平臺在AI for Science領域的強大能力。

超越AlphaFold2，連續(xù)保持全球第一排名!

由瑞士生物信息研究所和巴塞爾大學聯合舉辦的 CAMEO(Continous Automated Model EvaluatiOn)——全球持續(xù)蛋白質結構預測競賽，被認為是蛋白質結構預測領域最重要的比賽之一。

CAMEO 競賽的規(guī)則是，每位參賽者需每周對 20 個由世界范圍內的結構生物學家最新破解出的蛋白質結構進行預測，其分數和名次每周都會進行在線更新。

因此，該競賽吸引來不少世界范圍內生物計算領域的前沿模型“選手”?；跁N思MindSpore AI框架訓練的蛋白質結構預測模型，一經亮相，便領跑全球。在最近的三周CAMEO競賽中持續(xù)排名第一，意味著昇騰AI基礎軟硬件平臺在AI for Science領域的強大能力。

昇思MindSpore蛋白質結構預測模型研發(fā)進展

2021年11月，昇思MindSpore團隊與昌平實驗室、北京大學生物醫(yī)學前沿創(chuàng)新中心(BIOPIC)和化學與分子工程學院、深圳灣實驗室高毅勤教授課題組聯合推出基于AlphaFold2算法的蛋白質結構預測推理工具，并在2022年2月實現訓練的全流程打通，效率同比提升2-3倍。

采用昇騰AI基礎軟硬件平臺后，在混合精度下，單步迭代時間由20秒縮短到12秒，性能提升超過60%。依托昇思MindSpore內存復用能力, 訓練序列長度由384提升至512。

在訓練精度接近AlphaFold2的基礎上，昇思MindSpore在算法、規(guī)模和軟硬件支持等方向上持續(xù)改進，本次發(fā)布的蛋白質結構預測模型成績持續(xù)刷新業(yè)界記錄、拿下CAMEO競賽第一，毫無疑問是昇思MindSpore在蛋白質結構預測領域的又一里程碑，在填補國產AI基礎軟硬件在蛋白質結構預測領域成績空白的同時，更加證明了其價值與優(yōu)越性。

未來，針對蛋白質結構預測問題，昇思MindSpore將攜手學術科研界更多合作伙伴，在蛋白質結構預測領域共同探索、持續(xù)突破，助力國內相關基礎研究，尤其是生命各分支學科的進步，推動創(chuàng)新制藥行業(yè)的發(fā)展。

昇思MindSpore

昇思(mindspore.cn)是新一代全場景AI開源框架，支持端、邊、云全場景靈活部署，開創(chuàng)全新的AI編程范式，降低AI開發(fā)門檻，旨在實現開發(fā)友好、運行高效、部署靈活三大目標，同時著力構筑面向全球的人工智能開源社區(qū)，推動人工智能軟硬件應用生態(tài)繁榮發(fā)展。

原文標題：連續(xù)霸榜!昇思MindSpore蛋白質結構預測模型拿下全球競賽第一

文章出處：【微信公眾號：華為計算】歡迎添加關注!文章轉載請注明出處。

審核編輯：湯梓紅