Nanodcal是一款基于非平衡態(tài)格林函數(shù)-密度泛函理論(NEGF - DFT)的第一性原理計算軟件,主要用于模擬器件材料中的非線性、非平衡的量子輸運過程,是目前國內(nèi)擁有自主知識產(chǎn)權(quán)的基于第一性原理的輸運軟件??深A(yù)測材料的電流 - 電壓特性、電子透射幾率等眾多輸運性質(zhì)。
迄今為止,Nanodcal 已成功應(yīng)用于1維、2維、3維材料物性、分子電子器件、自旋電子器件、光電流器件、半導(dǎo)體電子器件設(shè)計等重要研究課題中,并將逐步推廣到更廣闊的電子輸運性質(zhì)研究的領(lǐng)域。
本期將給大家介紹Nanodcal分子電子學(xué)3.2.1.2-3.1.3的內(nèi)容。
3.2.1.2 搭建C9H5NS2分子結(jié)構(gòu)
(1)從數(shù)據(jù)庫中導(dǎo)入leucoline晶體,F(xiàn)ile—Import,找到leucoline.hzw導(dǎo)入(如果DeviceStudio版本較低,可以在附件中找到leucoline.hzw并導(dǎo)入);
圖 3-25:
(2)點擊Hydrogen passivation,給分子加氫;
圖 3-26:
(3)點擊3D Viewer下的yx View按鈕;
圖 3-27:
(4)選中下圖中的H原子;
(5)雙擊Properties欄下ElementSymbol的H,在元素周期表中選擇S替換;
圖 3-29:
(6)選中下圖中的C原子,可以在Properties欄中看到該原子的位置信息,再點擊Move Atom,選中所有原子進行平移,使得紅框中的原子的坐標變?yōu)閇0,0,0];
圖 3-30:
(7)點擊Angle測量出下圖所示的角度;
圖 3-31:
(8)點擊Rotate Atom,進行如下旋轉(zhuǎn)操作,將兩個S原子處于同一個XY平面內(nèi);
圖 3-32:
3.1.3 搭建Al-C9H5NS2-Al Bulk體系
(1)選中整個分子,右擊Copy,點擊之前建好的Al電極的hzw文件,在空白處右擊Paste;
圖 3-33:
(2)點擊3D Viewer下的yx View,再點擊Move Atom,適當(dāng)?shù)南蛏弦苿臃肿拥奈恢檬沟梅肿雍虯l電極沒有交疊;
圖 3-34:
(3)點擊Distance測量S原子到特定Al原子的距離;
圖 3-35:
(4)點擊Move Atom,選中分子并移動,使得S原子到特定Al原子的距離相等,并且S原子與特定Al原子在用一條直線上;
圖 3-36:
(5)點擊Convert to Crystal,按下圖中的Primitive Vectors進行輸入;
圖 3-37:
(7)將該Bulk體系的信息導(dǎo)出為VASP的輸入文件Simulator—VASP—VASPInput,固定Al電極只馳豫分子的結(jié)構(gòu),對于VASP的操作,這里不展開介紹;
圖 3-39:
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原文標題:產(chǎn)品教程|Nanodcal分子電子學(xué)(Al-C9H5NS2-Al分子器件輸運02)
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