北鯤云超算平臺如何加速生命科學(xué)研究

提到北鯤云，許多業(yè)內(nèi)同僚首先想到的是，這是一家為有提供高性能算力SAAS服務(wù)及整合企業(yè)線下及云上資源，提供安全、彈性、自主的企業(yè)級Cloud-HPC方案的云計算公司。隨著云計算基礎(chǔ)設(shè)施和技術(shù)的成熟，諸如生命科學(xué)、人工智能、芯片設(shè)計、工業(yè)仿真、大氣海洋等行業(yè)對于云計算的需求快速增長。北鯤云正是基于這樣的市場需求自主研發(fā)了北鯤云超算平臺，今天我們以生命科學(xué)行業(yè)為例，具體看看北鯤云超算平臺是如何加速生命科學(xué)研究的。

眾所周知，高性能計算在生命科學(xué)領(lǐng)域中的應(yīng)用是近幾年才出現(xiàn)的，而且主要應(yīng)用在基因測序、分子動力學(xué)模擬，以及虛擬篩選等流程。簡單來說就是通過實驗儀器對生物分子進行測量，然后使用一些后處理軟件對原始的大量數(shù)據(jù)進行處理和分析，接著對序列數(shù)據(jù)進行同源及相似性搜尋、比對、序列分析、遺傳發(fā)育分析等。而分子動力學(xué)模擬則是對于原子和電子所構(gòu)成的多體系統(tǒng)，用計算機模擬原子核的運動過程，從而計算這個多體系統(tǒng)的結(jié)構(gòu)和性質(zhì)。虛擬篩選是根據(jù)模擬小分子配體與生物大分子受體的相互作用，預(yù)測兩者間的結(jié)合模式和親和力，從而進行藥物的虛擬篩選。

藥物的虛擬篩選是依靠其所收集的基因測序的數(shù)據(jù)以及生物分子結(jié)構(gòu)的數(shù)據(jù)庫為基礎(chǔ)，首先通過X射線-單晶衍射等技術(shù)獲得受體大分子結(jié)合部位的結(jié)構(gòu)，然后通過數(shù)據(jù)庫搜尋或者全新藥物分子設(shè)計技術(shù)識別得到分子形狀和理化性質(zhì)與受體作用相匹配的分子。簡單來說，有些類似與AI建模。對于人工智能系統(tǒng)來說，其所建立的參數(shù)規(guī)模越大，往往就越聰明。藥物的虛擬篩選也是一樣，當(dāng)其數(shù)據(jù)庫中，所收集的生物分子信息與基因序列越多，其所能產(chǎn)生先導(dǎo)化合物的可能性就越大。因此，效率也就越高。
然而，對于生命科學(xué)而言，基因測序與分子動力模擬所產(chǎn)生的數(shù)據(jù)量巨大，要建立如此大的模型算力成本自然十分高昂，很大程度上阻礙了科研人員對藥物虛擬篩選的深入研究。

針對這一難題，北鯤云創(chuàng)始人馮建新在公司成立之初就曾表示，北鯤云超算平臺是專注于為高算力需求的企業(yè)和科研人員提供靈活、高效的算力產(chǎn)品及服務(wù)，幫助客戶提升業(yè)務(wù)運行效率并有效降低成本。北鯤云超算平臺，通過接入主流公有云資源，并在全球擁有25個地域節(jié)點，超過10萬臺服務(wù)器，單集群節(jié)點可提供10，000核時算力，算力資源豐富，可隨時開啟高性能計算，作業(yè)排隊時間趨近于0.

北鯤云作為一家技術(shù)型公司，不斷提高云資源的優(yōu)化和管理，讓用戶真正體驗到云計算帶來的優(yōu)勢。